La differenza chiave tra elettroforesi su gel 1D e 2D sono le proprietà utilizzate per la separazione delle proteine ​​sull'elettroforesi su gel. L'elettroforesi su gel 1D separa solo le proteine ​​in base al peso molecolare mentre l'elettroforesi su gel 2D separa le proteine ​​in base al suo punto iso-elettrico e al peso molecolare.

La separazione delle proteine ​​mediante elettroforesi su gel è una tecnica importante per caratterizzare le proteine. Le proteine ​​hanno proprietà variabili; pertanto, la separazione è più complessa rispetto alla separazione del DNA mediante elettroforesi su gel di agarosio.

CONTENUTI

1. Panoramica e differenza chiave
2. Che cos'è l'elettroforesi su gel 1D
3. Che cos'è l'elettroforesi su gel 2D
4. Somiglianze tra elettroforesi su gel 1D e 2D
5. Confronto fianco a fianco - Elettroforesi su gel 1D vs 2D in forma tabulare
6. Riepilogo

Cos'è l'elettroforesi su gel 1D?

L'elettroforesi su gel 1D, nota anche come elettroforesi su gel monodimensionale, è un metodo di separazione delle proteine ​​basato sul peso molecolare. La separazione delle proteine ​​avviene principalmente mediante elettroforesi su gel di poliacrilammide. Sulla base del concetto di elettroforesi su gel, le molecole si separano dalle loro proprietà di peso molecolare e carica.

Pertanto, per dare una carica uniforme alle proteine, il trattamento con dodecil solfato di sodio (SDS) viene eseguito prima dell'elettroforesi su gel. SDS denatura le proteine ​​e fornisce una carica negativa uniforme sulla proteina; quando ha luogo l'applicazione del campo elettrico, le proteine ​​migrano verso il terminale positivo in base al loro peso molecolare. Pertanto, in separazione, viene considerata una sola proprietà. Questo è il motivo per cui questo metodo è definito come elettroforesi su gel 1D.

Durante l'elettroforesi su gel 1D, le proteine ​​vengono separate in base al loro peso molecolare. A questo proposito, le molecole a basso peso migrano più rapidamente nel gel rispetto alle proteine ​​ad alto peso molecolare. Pertanto, le proteine ​​ad alto peso rimangono vicine ai pozzetti.

Che cos'è l'elettroforesi su gel 2D?

L'elettroforesi su gel 2D o l'elettroforesi su gel bidimensionale separa le proteine ​​in base a due proprietà. Le due proprietà sono il punto iso-elettrico della proteina e il peso molecolare. Questo metodo di separazione proteica aumenta la risoluzione della separazione proteica. Il punto iso-elettrico della proteina dipende dal pH a cui la proteina è neutra.

Pertanto, nell'elettroforesi su gel 2D, la proteina può funzionare su un gradiente di pH fisso nella prima dimensione. Nella seconda dimensione, le proteine ​​vengono separate mediante elettroforesi su gel di poliacrilammide verticale o orizzontale. Pertanto, le proteine ​​si separano in base al loro peso molecolare nella seconda dimensione.

Inoltre, questo metodo di elettroforesi su gel aumenta la risoluzione della separazione proteica. Pertanto, le proteine ​​separate sono più pure. Tuttavia, il costo della tecnica è molto più elevato dell'elettroforesi su gel a una dimensione.

Quali sono le somiglianze tra elettroforesi su gel 1D e 2D?

  • Entrambe le tecniche separano le proteine. Quindi, sono importanti nel caratterizzare le proteine.

Qual è la differenza tra elettroforesi su gel 1D e 2D?

La differenza chiave tra elettroforesi su gel 1D e 2D è che l'elettroforesi su gel 1D separa le proteine ​​in base solo al peso molecolare mentre l'elettroforesi su gel 2D separa le proteine ​​in base sia al punto iso-elettrico che al peso molecolare. A causa di questa differenza di base tra elettroforesi su gel 1D e 2D, anche la risoluzione della separazione delle proteine ​​e il costo delle due tecniche variano. L'elettroforesi su gel 2D mostra un'alta risoluzione dell'elettroforesi su gel 1D. Tuttavia, l'elettroforesi su gel 2D è più costosa dell'elettroforesi su gel 1D.

Di seguito l'infografica riassume la differenza tra elettroforesi su gel 1D e 2D.

Differenza tra elettroforesi su gel 1D e 2D in forma tabulare

Sommario - Elettroforesi su gel 1D vs 2D

La separazione delle proteine ​​dipende da molti fattori. L'elettroforesi su gel 1D separa le proteine ​​solo in base al peso molecolare. Tuttavia, l'elettroforesi su gel bidimensionale o 2D aumenta la risoluzione della separazione proteica. Inoltre, l'elettroforesi su gel 2D separa le proteine ​​in base al punto iso-elettrico e al peso molecolare. Pertanto, questi dati sono importanti per l'elaborazione a valle delle proteine ​​e nel campo della proteomica. Quindi, questo è il riassunto della differenza tra elettroforesi su gel 1D e 2D.

Riferimento:

1. Galeva, Nadezhda e MichailAltermann. "Confronto dell'elettroforesi su gel monodimensionale e bidimensionale come strumento di separazione per l'analisi proteomica di microsomi di fegato di ratto: citocromi P450 e altre proteine ​​di membrana". Proteomica, Biblioteca nazionale americana di medicina, giugno 2002, disponibile qui.

Immagine per gentile concessione:

1. "Elettroforesi - Riempimento di pozzetti di gel 1D con miscela di proteine" di Jean-Etienne Poirrier - Riempimento di pozzetti di gel 1D con miscela di proteine ​​(CC BY-SA 2.0) tramite Commons Wikimedia
2. "Elettroforesi 2D" del National Institute of Health - Centro per la ricerca sul cancro Programma di nanobiologia, National Institute of Health (Public Domain) via Commons Wikimedia